FFmpegX kan ta en massa filer på samma gång, det är bara att dra in en ny film i FFmpegX och klicka Encode medan en annan håller på att konverteras!
När du har dem i "batchlistan" så kan klicka på den lilla play-knappen vid de videorna som står i sin tur i kön ifall du vill att flera video ska konverteras simultant, dock rekommenderar jag att du inte kör mer än 1 video per processorkärna. Själv brukar jag bara ha videorna i kö så datorn tar hand om en i taget, jag tror man får stabilare konvertering då.