Ledsen att jag spammar tråden, men här kommer avslutningen.
Det fungerade att lägga tillbaka 1.1.1 SMS.app så fungerade det igen. Dock bara genom att kopiera via SSH. Jag kopierade via APFd första gången och då verkade filerna inte stämma överens.
Har upptäckt problem med APFd tidigare. När jag te.x. editerade så att telefonen vibrerar längre vid SMS så syntes inte den filen via APFd.