För övrigt, om du gör en kopiering med tex CarbonCopyCloner och det slutar med en massa fel liknande dom du har nu.
Gör om alltihop.. det är oftast bäst i längden.
Innan du kör kopieringen, kör skivkontroll på orginaldisken.
Se till att du har senaste CCC för ditt OS, äldre versioner kan seriöst strula till ditt system.
Radera måldisken manuellt, prova att skapa några filer på den och se om den fungerar normalt innan du klonar allt.