Vad beccu vill göra är inte att kunna högerklicka i Windows, utan att stänga av VMWares inställning som gör att ctrl-klick tolkas som högerklick. Detta är inget som har att göra med systemets inställningar, utan det handlar bara om hur just VMWare fungerar.
När du är i VMWare - gå in i menyn VMWare Fusion > Preferences > Keyboard & Mouse > Mouse Shortcuts. Där har du inställningen att ctrl + musknapp = sekundärklick. Kryssa ur den.