Min macbook alu har lite samma fenomen. Apple's "accelerometer" är väldigt känslig på de senare macbookarna. Min macbook parkerar läsarmen även vid väldigt små "stötar", som tex när jag ibland ställer ifrån mig datorn. Detta är inget att vara orolig för, datorn är designad att göra så.
Jag har kört diagnostikverktyg flertalet gånger och kontrollerat hur många "skadade" sektorer disken har och dessa klick är helt utan tvekan inga klick som beror på dåliga sektorer.
Vill du vara 100% säker på att det inte är något fel på din hårddisk så bränn ut ett exemplar av ultimate boot cd och kör en hårddiskdiagnostik.