Vet inte om jag fattat vad du är ute efter helt rätt men försöker svara:
Den interna och externa skärmen förhåller sig till varandra så som upplösningarna förhåller sig till varandra. dvs har du en extern skärm med 1920x1080 och en 13" MB-skärm med 1280x800 och lägger dem på varandra så kommer det alltså "saknas" 280pixlar bredd, dvs där finns inte det andra skärmen. Precis som du hade ställt två olika stora skärmar bredvid varandra.
Positioneringen av hur skärmarna förhåller sig till varandra påverkar var du får denna "döda" yta. Så svaret på första frågan är; nej, om du inte ändrar den externa skärmens upplösning.
Så vitt jag vet kan du inte få den interna skärmen att slockna automatiskt men du kan ju lägga docken på den externa skärmen och sen bara sänka belysningen på de interna (använder du dessutom externt tangentbord och mus kan du ju köra i clamshell mode). När du har båda skärmarna inkopplade så kan du på den skärmen med docken välja "arrangement" under displays i systeminställningar. Där kan du dra den vita menyraden till den externa skärmen så kommer även dockan med. Och här kan du även positionera de två skärmarna som du vill.