Vad som än är fel så beror det inte på detta "behörighetsproblem", du kan sluta leta fel där. Jag har 10.10.5 (vad har du?) och får exakt samma felmeddelande. Om jag kör en behörighetsreparation, omstart och ny kontroll i Skivverktyg så kvarstår samma "fel".
(Att reparera behörigheter är överskattat och hjälper bara sällan. En kontroll av behörigheter är bara en kontroll där vissa filer jämförs med det kvitto som skrevs när filen installerades. Filens attribut kan ha ändrats av en helt legitim anledning, utan att det avspeglas i installationskvittot. Tidigare versioner av OS X var ofta behäftade med "felaktiga felrapporter" i Skivkontroll, gick att googla fram listor på vilka man skulle ignorera. Numera är det bättre. Men just denna har vi gemensam och den är troligen helt ok att ha i Yosemite!)
Men du har uppenbarligen ett problem med din dator. En vild gissning är att det är något fysiskt fel på hårddisken. Det är i alla fall bra att utgå från det och som första åtgärd se till att du har en aktuell backup! En annan gissning om datorn bara låser sig är fel på RAM-minne.
