Jag tycker inte att det verkar så märkligt. Både tangentbord och mus hänger ju internt på en USB-hub. Alltså är det säkerligen en "enumerering" av alla anslutna USB-enheter som görs och drivrutiner läses in allt eftersom där det fallerar, alternativt att systemet väntar på att nåt ska laddas klart innan en sökning på USB-enheter görs för att kika på vad som är istoppat.
Du har inte nåt annat hängandes på en USB-port? Inga konstiga drivrutiner installerade för externa ljudkort/nätverkskort eller liknande där programmakaren explicit laddar dem även om enheten inte finns istoppat i datorn? Kanske att din Bluetooth eller Facetime-kamera inte fungerar som de ska (i min MBP ligger de före tangentbord/mus i listan med USB-enheter)?