Har du tittat på inställningarna, så att de ser korrekta ut? Det kan ju vara något som har råkat bli nollställt eller ändrat i samband med uppgraderingen. Kanske inte så trolig teori, men bra att kolla detta innan man felsöker vidare.
Om det ser korrekt ut där, så brukar nog den enklaste åtgärden vara att bara ta bort kontot och lägga till det igen. Går oftast mycket snabbare än att felsöka. (Men förutsätter då att du kör IMAP. Om det är POP, med mejlen lagrade lokalt, så måste man tänka på backup innan man tar bort kontot.)