Tror knappast att Apple inte vill att folk ska använda RAID som startdisk, de bryr sig nog inte om vad man använder...
Men kopiera över allt viktigt på en extern disk eller bränn ut på skiva, installera om 10.4 och dra ner den stora uppdateringen (Combo eller vad det heter) och kolla om det kan hjälpa, kan ju ha blivit något fel när det installerades... :S