Testa att skapa en ny användare och se ifall det går snabbare. Om man har kört med samma användare väldigt längre som lagras det mycket skräp och annat som kan sega ner.
Om det verkligen är så långsamt att du inte står ut så testa att installera ett fräsht system.
Om du stänger av din dator eller har den i vila under nätterna så kan inte den köra sina daily/weekly/monthly script som rensar datorn från gamla temp-filer och dylikt.
Som Miggs sa kan du testa MacJanitor och se ifall det hjälper.