Det går bra. Om du kör OS X, starta Skivverktyg och välj Radera-fliken. Klicka på den partition du vill radera, och tryck "Radera."
Om du kör OS 9, markera partitionen direkt på skrivbordet och gå till "Special"-menyn. Där finns samma alternativ. Du kan inte radera den partition som är startskiva för tillfället, men det märker du ju.
Men annars tror jag att du från Linux-installationen kan radera utvalda partitioner. Ta en backup först, om du vill spara nåt på disken.