Det programmet verkar göra vad du vill.
Hade du använt Entourage hade jag rekommenderat tex Entourage Email Archive http://www.versiontracker.com/dyn/moreinfo/macosx/14011 ($30)
En annan lösning är helt enkelt att skriva ett Applescript som tar ett email i taget och lägger in det i ett Excel-ark eller en FM-databas eller en textfil.
Från Excel kan du spara tex som CSV (Komma-separarade värden) eller textfil eller SQL-fil (du får lägga till massa grejer mellan varje fält, dvs sql-koden för en insert).
Från FileMaker kan du göra ungefär samma sak, spara som CSV, text eller SQL. FileMaker kan även (detta kan kräva en plugin och lite mera "joxande"), skicka SQL-kommandon direkt till din MySQL-databas via ODBC eller JDBC och skjuta in posterna i den direkt. Den senare lösningen är bra om du gör detta ofta.