Meddela buggen till Apple och vänta på nästa version. Safari 3 är ju en beta, och då får man räkna med att allt inte är som det ska - och helst rapportera de fel man hittar.
Kan du inte hålla dig till tåls så är det enda alternativet just nu att ta bort 3:an och gå tillbaka till version 2.
Edit: Passade på att vara en god betatestare och gjorde som jag själv föreslog, men jag tror nog att Apple redan fått ett antal rapporter om den buggen.