Hände liknande med min G4:a för några år sedan. Det visade sig vara något fel på B-trädskatalogen, så att alla mina fina filer försvann av sig själva allt efter som minuterna gick...
Kan även vara att du har en trasig sektor där den hänger sig, då beter den sig så också. Det kan man oftast fixa med SpeedTools "Media Scanner", som dock kostar en slant, men som fixar till trasiga sektorer.
Bäst är att du gör backup på allt viktigt i vilket fall som helst!