Jag tror också att "problemet" är att fönstret lägger sig under dockan, t ex när den är på höger sida av skärmen. Och scroll-listen hamnar under dockan.
Enda lösningar jag kan ge, är att anpassa fönster så att den inte sträcker sig under dockan, när denne är på vänster eller höger sida.
Om du har en liten skärm och vill använda maximal skärmyta, så är mitt råd att dölja dockan automatiskt. Så gjorde jag när jag hade 12" PowerBook.