Inte exakt vad du söker, men så här har jag gjort:
Alltså i terminalens inställningar har jag gjort en ny inställning för varje host (i listan till vänster). Där har jag rattat in en bra färg så jag kan skilja terminalerna åt om jag har många öppna. Namnet på inställningen är samma som hosten jag connectar mot.
Under fliken "Kommandotolk" kan man slå in det ssh-kommando (eller script) som skall köras istället för bash då terminalen öppnar.
För att öppna en ny terminal kan jag nu högerklicka på terminalen i docken för att få upp en meny. Under "nytt fönster" har du alla dina inställningar att välja mellan.
Detta funkar OK, men helst skulle jag vilja spara varje inställning i ett dokument, och då jag "öppnar" dokumentet så öppnas rätt terminal. Då kunde man lägga dokumentet i docken eller en stack. Man kan ju idag spara en inställning till en fil, men då man öppnar filen så importerar terminalen inställningen och gör en dubblett - inte riktigt vad jag ville...