Skumt, de borde synkroniseras.
Jag har en "smart" spellista i iTunes som jag synkar ihop med min iPhone. Där har jag inställningarna att om låten har betyget "1 stjärna" så vill jag inte ha den i iPhone, har den betyg "5 stjärnor" så ska den absolut vara med i min iPhone. Om låten inte har något betyg så ska den finnas i min iPhone om jag inte lyssnat på den de senaste 3 dagarna.
På så sätt kan jag ställa in betygen i iPhone och välja bort låtar som jag inte gillar genom att sätta betyg "1 stjärna" och låten försvinner vid nästa synkning.
Ingen direkt hjälp på ditt problem, men betygen ska följa med/uppdateras vid synkning.