Om du har Actual Technologies drivrutin så gör man så här, men det skriver du ju inte...
1. Se inlägg 22: http://www.99.se/filemaker/220424-filemaker-9-0-koppla-ihop-webshop-mysql-med-filemaker-i-praktiken.html
2. I samma tråd ser du hur man kan bygga en databas i FM som innehåller en tabell från MS SQL. Vilket betyder i praktiken att du får en sorts front-end mot SQL-databaser och har tillgång både till data "därborta" och FileMakers alla fiffiga verktyg för att skapa layouter, manus, speciella utskrifslayouter, knappar, relationer osv osv.
När tabellen väl finns där kan du exportera, importera från/till som du vill.
Du kan även använda import-steget i FM via manus tex.
Använder du något som heter ScriptTimer (har jag nämnt i andra trådar), så kan du få FM att köra script på bestämda tider.
Läs även denna tråd för lite flera ideer:
http://www.99.se/filemaker/247628-optimera-f-r-hastighet.html
Informationen som fattas i din fråga är hur, vad, när, varför, med vad. Inte så mycket.