Det är en bugg i Apples senaste uppdatering av raw-stöd, Digital Camera Raw Compatibility 2.3. Efter man installerat den roteras inte bilder automatiskt längre, inte Nikon NEF (Nikons raw-format) i alla fall.
Vad värre är, det verkar som om originalen får felaktig rotationsinfo, så även om Apple fixar bugger är det fel på bilderna man redan importerat. Det gäller både Aperture och iPhoto så vitt jag förstått det.
En tillfällig lösning verkar vara att kopiera bilderna till disk först och sen importera dom. En annan är att nedgradera till Camera Raw 2.2. Behöver man stöd för Nikon D90 är det senare inte ett alternativ dock, eftersom stödet kom just i 2.3.
Enligt uppgifter så fungerar inte heller funktionen att inte importera dubletter, det är min egen erfarenhet i alla fall.
Läs mer här:
Apple - Support - Discussions - Automatic rotate/orientation now broken? ...