Undrar detta jag med. Tills Apple tycker att detta är ett problem som existerar så kan du pröva med SleeplessHD eller Disksomnia - bägge finns på MacUpdate/VersionTracker om du söker efter namnen. Fungerar sådär men är det bästa hittills.
Och nej, pmset eller funktionen "put disks to sleep" (låt hårddisken vila eller vad den heter på svenska) i energipanelen fungerar inte med externa diskar. Den senare stängs inte heller av när man bockar ur den utan istället sätts timern till tre timmar...