Kanske lite sent men så här är det:
På FileMaker Server ställer du in att användare bara får se sina databaser. I FileMaker Server 10 finns det i admin-verktyget under Konfiuration/Databasserver, fliken Säkerhet, valet heter "Lista endast de databaser som varje användare har åtkomstbehörighet till". Samma funktionalitet finns även i tidigare versioner (i varje fall 7 och senare).
När FlieMaker-klienten väljer Arkiv->Fjärröppna och markerar servern som man vill ansluta sig till måste användaren först ange användarnamn och lösenord. I listan visas sen de databaser som har det användarnamn/lösenord som man angett.. När användaren öppnar någon av de tillgängliga databaserna får man ange användarnamn/lösenord igen.
Ett alternativ är att man inte visar någon databas alls i listan och låter FileMaker-klienterna öppna databasen med en genväg som t.ex. beskrivs här: http://www.filemakerbloggen.se/post/Starta-databas-med-genvag.aspx
Du väljer att inte visa en databas i listan i respektive databas. Välj Arkiv->Dela databas->FileMaker-nätverk (FileMaker 10) och kryssa i rutan Visa inte i dialogrutan Fjärröppna fil.