Jag råkade ut för liknande problem. Skulle installera uppdateringen på en dator som jag styrde med Remote Desktop. Allt började bra, men datorn kom aldrig online igen efter uppdateringen. Åkte ner till kontoret och datorn har fastnat med en kernel panic. Vet inte exakt vad som gått snett, men det stod något om mismatch mellan kernel och OS version.
I alla fall så startade jag upp datorn i Firewire Target Disk mode och kopplade in den i en annan dator. Körde sen 10.5.8 kombo-uppdateringen därifrån, och nu funkar allt som det ska igen.