Ja, iPhoto vet vad den ska göra, om man bara har ett (1) bibliotek.
Men här är det du själv som har ställt till det genom att skapa två bibliotek, och då kan inte iPhoto veta vilket av dem du vill arbeta med. Då håller man nere Alt när man startar iPhoto, och så väljer man vilket bibliotek man vill arbeta med.
Om du sedan vill slå ihop dem, så finns det lösningar för det också.