Du kan alltid ta bort den från App Store oavsett anledning. Den avinstalleras dock inte automatiskt. Förhoppningsvis har du dock redan bra logik i ditt program som hanterar situationen att API-anropen inte fungerar.
För att göra situationen mycket bättre för användarna skulle du kunna tillhandahålla källkoden till programmet under en fri licens. Det kan ju t. ex. hända att någon annan vill och kan utveckla programmet vidare även om du inte gör det.