Folder Actions borde väl passa utmärkt för just det här? Jag har själv inte använt det, men en snabb koll visar att det finns ett färdigt applescript som poppar upp en inforuta när en fil läggs till i en given mapp.
Du skulle alltså kunna skriva om skriptet "new item alert.scpt" så att det istället för att visa info, flyttar filen till en annan mapp. Sedan aktiverar du det skriptet för din Desktop-mapp.