Testa att ändra rättigheterna på minnet, så att "system" inte har skrivrättigheter. Jag vet inte om det funkar, men det borde kunna gå. Eftersom det inte är du som lägger dem där, så kanske det går att hindra datorn från att göra det själv.
Filer som börjar med punkt, syns inte i UNIX. Det verkar lite märkligt att du får så många filer. Man brukar få en DS-store bara...
Du kan radera dem genom att söka efter dem på minnet, och klicka i "visa osynliga filer". Det borde gå ganska snabbt.