Du måste skapa ett nytt projekt (och ha en target) för att kunna bygga. Är det bara en enkel klass så tror jag att du ska välja "Java Tool" som projekttyp.
Annars är det nog enklare att kompiler från terminalen med javac.
Ska du köra lite mer avancerad java programmering så finns det bättre miljöer för ren java-programmering som Eclipse och NetBeans t.ex (båda är gratis).
Joakim