Eftersom du väljer manuell synkning så kommer inte låtarna att försvinna ifrån iPoden om inte du väljer att synka. Så gör som ngn tidigare sa, välj manuell synkning och för över låtarna från datorn. Jag gör själv likadant. Mitt förslag till dig (eftersom jag antar att du har usb 1 med tanke på din HD storlek) är att du först överför låtarna till iTunes bibliotek. Här namnger du idg tagsen, eftersom det tar tid om du först ska överföra dem till iPoden och sedan göra idg taggarna.
När du namngett idg tagsen så överför du biblioteket till iPoden. När detta är klart raderar du biblioteket (Alltså iTunes bibliotek, inte iPodens). Nu för du över nya låtar till biblioteket igen och namnger dessa, osv.
Har gjort detta ett antal gånger eftersom jag har samma problem som du.