För det första finns det en del problem med att installera linux på iPod med färgskärm, alltså de som släpptes efter photo men innan 5G. Jag har själv ingen sådan så jag vet inte riktigt vad problemen innebär, men enligt uppgift så ska det gå om man gör som dontlookdown487 säger i den här tråden.
Det värsta som kan hända är att du blir tvungen att formatera iPoden med iPod-uppdateraren, så se till att du har backup på alla filer.
Just musikuppspelningen i linux (med photo, som jag använt) är sådär. Man kan navigera i menyer liknande de i det vanliga gränssnittet men det är lite instabilt. Dessutom kommer inte musikuppspelning fungera om du har podcasts på iPoden.
Lycka till!