Okej, jag har funderat lite, men jag vet inte om det funkar.
I iTunes mappen (Min Musik > iTunes) ligger det ju två datafiler (iTunes Music Library och iTunes Library). Det är ju där själva iTunesbiblioteket ligger sparat, alltså ID3-taggarna och sökvägarna till filerna.
Man borde alltså kunna ta en kopia av dom som ligger i iTunes-mappen, klistra in dom på tex Skrivbordet. När detta är gjorde redigerar den ena biblioteket som den vill ha det, var efter man byter plats på filerna i iTunes-mappen och skrivbordet (kan ju också vara smart att byta namn på dom så att man inte blandar ihop dom). Sedan, när du filerna som låg på skrivbordet ligget i iTunesmappen, går nästa in och redigerar sitt iTunes bibliotek. Sen är det bara att ha det där filerna liggande i en mapp (byter namn på dom till sitt eget namn eller nått) och klistra in dom i iTunes mappen när man ska synka med sin iPod.
Låter nog krångligare än vad det är, jag tror det är en ganska bra lösning. Men jag har inte testat den, men det borde fungera. Kan kanske blir det problem om man byter namn på filerna. Men värt och testa (det är ju bara ta en back-up på du befintliga filerna i iTunesmappen)