Hej!
iPhoto-bibliotek flyttar man med att hålla ner "alt" och skapa ett nytt bibliotek där man vill ha det, sen importerar man det gamla biblioteket INNAN man raderar det (brukar bli bättre om man har bilder där som man vill ha kvar). Sen är ju mapparna dokument, musik etc bara mappar med speciella ikoner.. De kan du ju bara dra ur finderfönstret, och sen skapa nya mappar med samma eller liknande namn på din nya hårddisk och dra mapparna till sidan i finderfönstret. De fungerar ju som en sorts genväg.
Annars håller jag med om att det är skönt å ha datorn "ren". Jag gör alltid en ren installation av OSX på en partition på interna disken, sen lägger jag alla mina filer på den andra partitionen, och nya program på systemskivan. På så sätt känns det som att man inte har lika mycke saker som kan ställa till det i filstrukturen. Men det kan vara psykiskt också.. (fast jag gjorde precis en nyinstallation av mitt system, som går riktigt mycke snabbare nu).
Lycka till!