Tror att jag har löst problemet. Är 90% säker att det var senaste winamp med sin ipod-plugin (som jag upptäckte för någon dag sen) som på nåt sätt störde. Jag fick en tanke att det kunde ha med det att göra så jag testade att stänga av winamp så att den inte var igång samtidigt som jag kopplade in iPoden till datorn och nu fungerar allt som det ska.
Jag har letat som en dåre på olika iPod-forum men jag har ingenstans stött på att nån varit med om detta.