Se vad iTunes säger, prova att synkronisera om, annars vet jag inget förutom att köra en restore.
Det tar ju inte så lång tid att göra det nuförtiden, med ziphone eller iPlus eller liknande program, även om det är lite segt. Finns bra guider här på forumet. Tog cirka en halvtimme för mig med iPlus.
Om du har SSH installerat kan du säkert ta bort programmet manuellt via sFTP, men det vet jag inte hur man gör. Hoppas någon annan kan hjälpa dig.