Det är för att det inte är det rekommenderade sättet att göra PostScript-filer på. Den metoden som du använt skapar filer som går genom OS X:s utskriftssystem, och vars kvalitet därmed varierar beroende på din version av operativsystemet etc.
Det rätta sättet att göra en postscript-fil från InDesign är (och har alltid varit) att spara den som postscript-fil med InDesigns egen postscript-hantering