Hmm.... de-interlacing till 50fps kanske är klurigt ifall man inte köper proffsprogram. Ta en titt på FFMpegX iaf, den brukar klara allt jag behöver iaf, dock har jag aldrig kört en sån de-interlace-metod. Jag tror inte man kan få en x264-film i en MKV-kontainer, men MKV är onödigt så länge du inte behöver extra språk och undertexter, jag tror du klarar dig fint med MP4 eller AVI kontainer.