Spotlight går på filnivå, oavsett om det är Finder eller något annat program som flyttar/kopierar filen.
Konstigt att flytt skulle ta mer tid än kopiering. Jobbar man på filnivå på OS X kan man flytta (mv) valfritt antal GB på nolltid så länge det är mellan mappar på samma device. Kopiering måste ju skyffla data vilket tar tid, beroende på typ av hårdvara på lagringsutrymmet. Har inte testat detta med Finder så mycket dock...
Det snabbaste är ju naturligtvis att inte hiva runt med filer utan använda sig av ett program med en databas där man organiserar genom att uppdatera metadata och aldrig fysiskt skyfflar runt sakerna.