De flesta program som har lite mer komplexa filformat sparar inkrementellt, dvs endast ändringar, inte hela filen. Med tiden kan därför filen innehålla en del gamla referenser som inte städats undan. Genom att "spara som" ber man de facto programmet att göra en genomgång av dokument-databasen och behålla endast aktuell data. Fördelen med detta är att det går väldigt mycket snabbare.
Acrobat gör dessutom mer än så. Vid en "spara som" rensas s.k. "private data" (applikationsberoende data från andra program) bort, vilket KAN ha till följd att filen inte längre går att öppna, eller att information går förlorad för ursprungsprogrammet (t.ex. Illustrator)
Anledningen till att InDesign-dokument blir stora är oftast att de innehåller mycket bilddata antingen i form av inbäddade bilder eller inbäddade (felaktiga) förhandsvisningar.
En bugg, är 72ppi-bilder som skalas ner i InDesign istället för t.ex. Photoshop. I de fallen inkluderar InDesign all bilddata, oavsett om bilden skalats ner till frimärksstorlek. Lösningen är att ändra upplösning i Photoshop (vilket ju alltid varit den rekommenderade arbetsgången)
