För att det ska gå att klistra in och fortfarande ha bilden redigerbar så måste du sätta Illustrators urklippshantering till AICB, jag tror pdf är standard annars, vilket inte blir redigerbart efter klistring. Troligen ska man klicka i "behåll banor redigerbara" eller liknande med, jag har inte illustrator tillgängligt just nu och kan kolla.
Vad gäller bildformat efter en sån manöver så tolkas det helt enkelt som om du hade ritat den från scratch i Indesign med Indesigns egna verktyg.