Om du har rätt inställningar behöver du inte rendera materialet. Se till att audio och videocapture har rätt inställningar för din kamera - DV-PAL, 48Khz ljud från "source" (alltså att den tar in det format du spelat in i. Många konsumentkameror är inställda på 32Khz som default och FCP brukar öppna i NTSC tror jag) 2x40 min är inga problem för FCP att hantera, ju snabbare dator desto bättre förstås.
Du måste ställa in rätt preferenser för sekvensen också. När du ändrat dem måste du skapa en ny sekvens för att de nya preferenserna ska börja gälla/alt ctrl-klicka på sekvensen du håller på med i browsern och ändra inställningarna.
Jag har gjort så som Treasurmine föreslår, fast det där med osynk i ljudet har med "capture direct" att göra. Om du loggar och "batch capture" klippen så ska du slippa osynk. Men du bör nog inte ta in klipp över 30 min i alla fall, både för att ha ett hanterbart klipp och för att slippa problem.