Kan bero på t.ex. hur du laddar upp eller hämtar filerna. Med t.ex. ftp är det viktigt att välja rätt transfereringsläge, binärt (bilder och annat) eller ascii (rena textfiler). Det kan bli skumma filnamn om man gör det fel.
Sen har jag för mig att det kan bli nåt kompatibilitetsproblem mellan *nix-servrar och Windowsservrar, men vettefan hur det var med det....