Både ja och nej, du kan ställa in vilken mapp nya låtar skall kopieras till, men du kan inte bestämma vilka iTunes ska "använda". Itunes fungerar så att när du lägger till en låt (så kopieras den till iTunes musik-mappen om man har det inställt) så läggs den till i iTunes databas.
Anledningen till att iTunes är så snabbt att söka i är just denna databas.
Dessutom kan du välja att samla ihop biblioteket då kopieras alla låtar som ligger på olika platser på hårddisken till en och samma mapp