Den enkla vägen: Lyft över all data till en annan disk, gör heldiskkryptering (eller kanske snarare ett gigantiskt arkiv då du verkar ska köra via nätåtkomst) på ursprungsdisken, lyft tillbaka.
Den jobbiga vägen: Skapa ett krypterat arkiv på disken, N GB stort. Flytta in så mycket data du kan. Skapa ett till arkiv, >N GB stort, flytta över all data från det gamla arkivet till det nya + så mycket okrypterad data du kan. Fortsätt tills du flyttat in allt.
Kan starkt rekommendera alternativ 1 ovan, 2 är massor med jobb.