Japp. De flesta program har alla programfiler i ett "programpaket" (som en mapp) som man vanligtvis lägger i mappen Program, men som egentligen kan läggas var som helst. Inställningsfiler mm sparas dock i din användarmapp eller i System/Library som i detta fall antagligen är på din SSD-disk. Men det är små filer.
Kan vara att vissa program (oftast större programsviter) måste ligga på start-disken, men då installeras de med ett installationsprogram som kommer protestera om du försöker installera på fel plats. Funkar nog ändå i de flesta fall att flytta över dom, men jag kan tänka mig att programmets interna länkar till t.ex hjälpfiler, scriptfunktioner mm kan bli fel.