Själv kör jag Bookends, som är en konkurrent till EndNotes.
Jag skrev en kort recension om bådas iOS dito för en grupp forskare och då kunde man inte lägga in nya böcker, tidskrifter etc i EndNote för iPad, så man var tvungen att mata in i EndNote på Mac och sedan synkronisera det med EndNote for iPad. Hur det är nu vet jag inte.
Bookends motsvarighet till Endotes for iPad som heter Bookends on Tap har inte det problemet. Där kan du mata in alla uppgifter på iPaden eller iPhonen och sedan synkronisera det med Bookends på Mac och visa versa.