Det beror på att iPhoto har ett eget bibliotek. Du kan utan att oroa dig slänga bilderna i mappen "Digitalbilder" när du lagt dem i iPhoto. iPhoto gör detta för att när du arbetar med bilderna så har den alltid originalet kvar att återgå till om du ångrar dig senare.
Jag tror inte att det finns något sätt att gå ifrån det beteendet. Det finns iofs många tips om iPhoto-konkurrenter som verkar lovande här på forumet. Någon annan kan säkert mer om dem än mig.