Är lite osäker på vad du menar med "embedded" i sammanhanget, eftersom inDesign normalt sett använder länkade bilder, dvs bilderna måste skickas med separat när du skickar filer till tryck - om du inte har exporterat hela dokumentet till pdf.
Men, det enkaste sättet att få ordning på vilka bilder som ligger var är ju att döpa dem på ett sätt som gör dem lätta att identifiera, innan de monteras i inDesign. Sedan har du ju en lista över alla använda länkar och bilder under fliken "Links & Images" i preflight, där kan du också se vilka bilder som är i RGB och vilka som är i CMYK.