Enklaste lösningen är att bara slänga plist-filerna och starta om datorn. Det skapas nya och jungfruligt rena inställningsfiler när de behövs.
Tja, plist-filen för ditt användarkonto innehåller för strängen AppleCurrentKeyboardLayoutInputSourceID fortfarande US. Jag gissar att detta sätts av det för tillfället inkopplade tangentbordet. Om du har ett svenskt tangentbord nu så är det fel, antingen på plist-filen (korrupt fil?) eller på tangentbordet. Vidare har din plist-fil under /Library ett avsnitt med AppleInputSourceHistory, det saknas helt hos mig, annars identiskt.
Men som sagt, ingen idé att grotta ner sig i hur plist-filer är uppbyggda, det enklaste är att systemet får göra nya. Jag testade att radera på båda ställena och behövde inte ens välja någon inställning vid omstart. För användarkontot skapades ny plist-fil utifrån det för närvarande inkopplade tangentbordet. Och under /Library har det ännu inte skapats någon ny, sker kanske först när jag börjar växla mellan olika användarkonton inställda för olika språk, eller haft något annat tangentbord inkopplat.
Testat på 10.11.6, iMac7,1 med trådat svenskt apple-tangentbord.