Jag testade att starta El Capitan via cmd + R och hade en ren Yosemite på sticka. Tyvärr går det inte att gradera nedåt utan att formatera om hårddisken. I mitt fall var det bara att installera om El Capitan, stänga av alla tilläggsprogram som startar upp vid omstart, och därefter fungerade allt som det (troligen) ska.