Det låter som om webbservern skickar ut PDF:en med fel mime-typ och därmed vet inte din webbläsare vad den ska göra med filen.
Kontrollera genom att skriva följande kommando i ett Terminalfönster:
curl --head "http://adress.till.pdf.du.vill.hämta"
Då får du information om vad för sorts fil webbservern menar att den skickar ut.
Kontrollera först att första raden är "HTTP/1.1 200 OK". Är den inte det kan det vara nåt annat strul, exempelvis stavfel eller mellanslag i adressen till PDF:en. (Ersätt varje mellanslag med teckensekvensen %20)
Längst ner i svaret finns värdet "Content-Type". Detta ska vara application/pdf (eller möjligtvis x-pdf) annars är webbservern felkonfigurerad. Påpeka i såna fall detta för er sysop.